三级警司和二级警员的区别在于衔级不同、警衔标志不同、职务不同、授予机构不同、晋级期限不同。

1、衔级不同：“三级警司”是指中华人民共和国人民警察警衔当中的第11级(共五等十三级)，警衔是区分人民警察等级、表明人民警察身份的称号和标志，是国家给予人民警察的荣誉。“二级警员”为中国警衔体系的最低等级，即第13级。

2、警衔标志不同：的警衔标志由银色横杠和银色四角星花组成，“三级警司”的警衔是一道银色横杠、一颗银色四角星花。“二级警员”的标志为1枚四角星花。

3、职务不同：科员（警长）职：三级警督至三级警司；办事员（警员）职：一级警司至二级警员。二级警员是警衔中的最低级别，三级警司要比二级警员高出一个级别，三级警司可以授予科员、办事员、专业技术初级等职位，二级警员只授予办事员。

4、授予机构不同：警司由省、自治区、直辖市公安厅（局）厅（局）长批准授予；警员由省、自治区、直辖市公安厅（局）政治部主任批准授予。

5、晋级期限不同：二级警员至一级警司，每晋升一级为三年；一级警司至一级警督，每晋升一级为四年。在职的人民警察在院校培训的时间，计算在警衔晋级的期限内。