账务处理系统的系统初始化工作包括建立账套、建立会计科目、初始数据录入、凭证类别设置。账务处理系统又称总账系统，是会计核算的核心，其他业务系统往往需要读取财务系统的数据进行核算，而且要将处理结果汇总生成凭证送账务系统统一处理。实际上许多企业一般都是从财务处理系统开始实行会计电算化的。

账务处理系统的基本原理是复式记账法，这是世界通用的会计记账方法，它包括“有借必有贷，借贷必相等”；资产=负债+所有者权益；总账余额发生额必须等于下属明细账余额发生额之和等一系列基本处理方法。账务处理系统是以货币作为主要计量单位，综合、全面、系统地反映企业供产销的所有方面，账务处理系统除直接采集部分原始数据进行加工处理外，还要把其它子系统处理后的综合性数据转入并进一步处理，以得到全面反映经济活动的总括性信息。