1、珍稀菇类如羊肚菌、灰树花、牛肝菌等价格高，但是人工栽培不容易，消费市场也不大，有的设施投资就很高，不见得当时就能挣到大钱，但发展前景广阔。平菇、香菇市场大，价格低，栽培起来容易，但是价格起伏较大，有时候栽培的多赔得多，也不见得能挣钱。

2、从贮存时间选择。有的菌类不耐贮运，如草菇、大球盖菇等，采摘后过几个小时就慢慢变质，栽培这些食用菌要配备加工条件，没加工条件的农民朋友要规模化栽培，以方便收购。

3、设施投资考虑好。同样是栽培双孢菇，工厂化生产设施产量高，质量好，还能周年化生产，但是投资太大，至少要投入几千万，不是一般农民朋友能选择的。选择土棚地栽方式，设施投资几千元就够了，但是效率低，每年只能出一茬菇，挣钱也不多。采用土棚或砖混结构，层架式栽培，投资几万元，占地面积不大但实际栽培面积扩大两倍多，虽然每年出一茬菇，效率提高了两倍多。

农作物秸秆都是禾本作物，含营养物质要比阔叶树木营养要丰富一些，并且非常容易被食用菌丝体分解，能够把秸秆中的营养达到80%的转化成食用菌产品，所以，秸秆利用率非常高，经济价值高。目前利用农作物秸秆栽培食用菌的品种一般情况下有蘑菇、平菇、香菇、金针菇、黑木耳、银耳、金耳、草菇、滑菇、猴头菇等等食用菌品种。