部分种族的蜥蜴会游泳，这个跟蜥蜴的生存环境相关，仅存的海生种族为海蜥蜴，主要食用海藻，水栖的食淡水食物。蜥蜴是变温动物，温度较低会进入休眠的状态，而生活在热带的蜥蜴，可终年进行活动，但有些也会出现夏眠的现象。

蜥蜴多在海拔1000米左右或以下的地区生活。少数种类可生活于海拔2000米左右的高山，如秦岭滑蜥、山滑蜥、康定滑蜥等。西藏沙蜥与喜山鬣蜥是垂直分布最高的少数蜥蜴，它们的生活地区常在海拔4000米左右。

蜥蜴生活环境各异，生活于地下、地表或高大植被中，沙漠及海岛中均可见。蜥蜴是变温动物，在温带及寒带生活的蜥蜴会进入休眠状态，表现出季节活动的变化。

在热带生活的蜥蜴，由于气候温暖，可终年进行活动，但在特别炎热和干燥的地方，会出现夏眠的现象，是为了度过高温干燥和食物缺乏的恶劣环境。