EMS清关要多久是不确定的，一般来说，要1-5天，具体海关清关时间要看海关的检查速度，正常情况下是1-3个工作日清关完成，如果是遇到货物有问题，比如违禁品或者需要申报缴税的，那么清关时间就会长一些。

正常情况下，海关方面一般在三个工作日完成查验，对于需要向海关申报被税的包裹，这时由快递公司通知收件人，收件人凭国际邮件领取通知单（或到货通知单）和身份证件到海关办理申报通关手续。海关工作人员不会在单一包裹上停留太长时间，因为要处理的包裹数量实在是太多了，如果包裹内有违禁品，检验检疫方面才会要求开箱检查，海关人员并不私拆包裹，包裹到达海关后，需要审批物品的报关清单，以及个人物品清关的身份验证。

海关对每一个包裹进行x光机的检验和部分包裹的拆箱查验，最后确认包裹无误后可放行派送。清关只有在履行各项义务，办理海关申报、查验、征税、放行等手续后，货物才能放行，货主或申报人才能提货。