1、外观不同：Pencil一代比二代更长，而且一代的表面是光滑质感，分为笔尖、笔身主体和顶部保护帽三个部分；二代的表面是磨砂材质的，哑光质感，分为笔尖和主体两个部分。

2、充电方式不同：充电方式是Pencil一代和二代做出的比较大的改动，一代采用的是将Lightning接头隐藏在顶部保护帽的下面，充电的时候要将其插入Lightning接口配对充电，是比较麻烦的方式。二代采用的是磁力吸附和无线充电的设计，笔身有一面可以吸附在iPad上，使用和存放都比较方便。但是其并不支持Qi无线充电协议，只能吸附于新款iPadPro上充电。

3、Pencil二代不再附赠笔尖，需要自行额外购买；

4、二代笔的内置电池要比一代的小，但是得益于吸附充电的设计，使得实际上使用的体感续航要长出不少。

5、二代在使用中，轻点两下就能切换工具，一代不支持。