混合肥料是由机械方法混合几种单一肥料、或一种单一肥料与二元或三元复合肥料混合而得。有时可在其中加入一些填充物，以改善肥料的物理和化学性质。如为防止硝酸铵和普通过磷酸钙所制成混合肥料产生的过度酸化，可加入一些石灰来中和土壤的过量酸度，以创造对作物生长更为有利的条件。有些单一肥料之间不宜相互混合，如硫酸铵和草木灰混合，会引起氮的损失。

一、可以混合的情况：如厩肥、堆肥与钙镁磷肥混合，厩、堆肥在发酵中产生的有机酸可以促进难溶性磷的分解。厩、堆肥与过磷酸钙混合，可以减少磷肥中的有效磷与土壤接触，防止磷被土壤的固定。酸性强的有机肥，如高位草炭与碱性肥料（如石灰、钢渣磷肥、石灰氮或草木灰等）混合时，碱性肥料中的碱性可以来中和草炭的酸性。人粪尿混入少量过磷酸钙可以形成磷酸二铵，减少和防止氨的挥发损失。

二、不宜混合的情况：某些未腐熟厩肥、堆肥不能与硝酸盐肥料混合，否则容易产生反硝化作用，引起氮的损失。新鲜的、含有大量纤维物质的有机物质，最好不要与矿质肥料混合，应该等到它腐熟后再与矿质肥料混合，不过也有例外，就是即使是腐熟的人粪尿也不要与碱性肥料混合，以免加速氨的挥发。