黄鳝全身只有一根脊椎骨，无肌间刺。腹腔膜褐黑色。肠短，无盘曲，短于体长，具肉食性鱼类相似特征。肠中段有一缩小处，将肠分为前肠和后肠。体内无鳔，即鱼泡，因而黄鳝不能像其它鱼一样停留在任意水层。黄鳝的鳃、口咽腔和皮肤都具有呼吸功能，可直接呼吸自然界的空气，因而可离水较长时间而不会死亡。

黄鳝的鳃丝很短，在夏季等水温较高，黄鳝的代谢旺盛时，黄鳝常常将头伸出水面，张口吸入空气，依靠口咽腔直接进行呼吸；而黄鳝冬季低温冬眠时，则主要依靠皮肤进行微弱的呼吸。黄鳝的心脏离头部较远，约在鳃后5厘米处。

鳝的内部器官包括心脏、消化道、肝脏、脾脏、肾脏、胆囊、性 腺等。消化道包括口腔、食管、胃和肠。口腔由上、下颌组成。食管位于口腔后面，为食物通道。肠呈直管状，直通泄殖孔。无胃、无鳔，腹腔膜黑色。肝脏较长。胆囊位于肝的末梢、肾脏的前端。 肾脏较小，在肝脏的后面。

一般黄鳝苗进苗的时间在6-7月。刚刚经过运输的鳝鱼体质本就不算好，应激性很大，这样的鳝鱼运输回来放到池塘里，很可能会出现应激反映，引起死亡，造成损失。所以放苗一定要选择连续3-5个晴朗、无北风的天气。