比目鱼有鱼鳞。比目鱼的身体表面有极细密的鳞片。比目鱼中最原始的科是鳒科，具有非常类似于鲈鱼的胸鳍与臀鳍，只有眼睛和长长的背鳍与海鲈鱼有所差异，这说明比目鱼是从鲈形目祖先进化而来的。比目鱼具有扁平的身体，眼睛只生长在身体的一侧，具有鱼类中独一无二的不对称结构。

许多比目鱼如佛鳎鱼、鲆鱼和大比目鱼都被当作食用鱼，并且有些种类具有相当重要的商业价值。比目鱼特殊的结构非常适于烹饪：它们能够迅速均匀地被烹熟，其鱼刺易于剔除，可以很容易地做成鱼片。

现生比目鱼类均是底栖鱼类，绝大多数为埋栖型鱼类。左右对称鱼类眼睛的视野范围由于头背部的阻隔，很少在头部上方有视野重叠区域（双视野），而比目鱼两只眼睛位于头部的同一侧，因此能够看到偏向头背中线的广阔的双视野区域。

比目鱼体甚侧扁，成鱼身体左右不对称，两眼位于头的一侧，口、牙、偶鳍均不对称。无眼的一侧通常无色素。刚出生的比目鱼体形和正常的鱼类是一样的，2只眼睛位于头顶两侧，并且具有一个居中的嘴巴。当幼鱼逐渐长大，一只眼睛便逐渐移动到头顶，直至另一侧，嘴巴也逐渐扭曲，直到成年比目鱼永久性地以单侧躺在海底。